وفي 15 مايو/أيار 2006، تم إنشاء اللجنة الاستشارية الرئاسية لحقوق الإنسان لتحسين وتيرة وكفاءة العمل على حل قضايا الأشخاص المفقودين من الديكتاتورية.

خدمة الطب الشرعي (Servicio Medico Legal, SML)، التي تعمل تحت إشراف وزارة العدل، مسؤولة عن تحديد هوية المفقودين وتحديد السبب المحتمل للوفاة. وتتلقى SML الدعم الفني في تحليل الرفات البشرية من المؤسسات الأجنبية بما في ذلك اللجنة الدولية لشؤون المفقودين، التي تشارك أيضًا في اللجنة الرئاسية.

وفي يونيو/حزيران 2008، وقعت اللجنة الدولية لشؤون المفقودين اتفاقية مع حكومة شيلي لتقديم المساعدة الفنية في التعرف على ضحايا الاختفاء القسري.

يعمل مختبر الحمض النووي التابع للجنة الدولية لشؤون المفقودين مع SML منذ عام 2009، حيث يقدم ملفات تعريف تكرارية قصيرة للحمض النووي (STR) للمرجع ومعروضات ما بعد الوفاة، ويقدم أيضًا المشورة الفنية بشأن مطابقة الحمض النووي. وتم تجديد الاتفاقية مع SML تباعًا، وكان آخرها في يونيو 2023.

اعتبارًا من ديسمبر 2023، قام مختبر الحمض النووي التابع للجنة الدولية لشؤون المفقودين بتوصيف 2591 عينة مرجعية، تمثل 1098 شخصًا مفقودًا؛ و439 عينة بعد الوفاة. حققت اللجنة الدولية لشؤون المفقودين معدل نجاح في تحديد مواصفات الحمض النووي STR بنسبة 72 بالمائة لعينات ما بعد الوفاة من تشيلي. قدم مختبر الحمض النووي التابع للجنة الدولية لشؤون المفقودين مساعدة مكثفة في مقارنة الملفات الشخصية وتقارير المطابقة، وأصدر 93 تقريرًا للحمض النووي يتعلق بـ التقديمات التشيلية.

انضمت تشيلي إلى اتفاقية اللجنة الدولية لشؤون المفقودين في عام 2015.